Классификационные QSAR модели острой токсичности органических соединений по отношению к Daphnia magna

Вениамин Юрьевич Григорьев, Александр Н. Раздольский, Анатолий О. Загребин, Валерий Д. Тонкопий, Олег Алексеевич Раевский

Аннотация


Для 443 органических соединений экспериментально определены величины LC50 по отношению к Daphnia magna. С использованием методов линейного дискриминантного анализа, k-ближайшего соседа, опорных векторов и искусственных нейронных сетей в пространстве из 77 молекулярных дескрипторов созданы классификационные модели для соединений с неспецифической и специфической острой токсичностью. На основе сконструированной консенсусной модели в обучающей и тестовой выборках достигнута общая степень правильного распознавания, превышающая 0,9. Предложенный в настоящей работе ряд органических соединений с охарактеризованными типами токсического действия и экспериментальными величинами LC50 может быть использован в качестве источника данных для проведения дальнейших токсикологических исследований.

Ключевые слова


острая токсичность; Daphnia magna; QSAR; HYBOT

Полный текст:

PDF

Литература


J. A. H. Schwöbel, J. C. Madden, M. T. D. Cronin, Chemosphere, 85(6), 1066 – 1074 (2011).

E. M. Mager, A. J. Esbaugh, K. V. Brixá et al., Comp. Biochem. Physiol. C., 153(1), 82 – 90 (2011).

J.-Q. Shi, J. Cheng, F.-Y. Wang, et al., Ecotoxicol. Environ. Saf., 78(1), 134 – 141 (2012).

S. Kar, K. Roy, J. Hazard, Mater., 177, 344 – 351 (2010).

R. J. Mitchell, A. L. Myers, S. A. Mabury, et al., Ecotoxicol. Environ. Saf., 74(8), 2260 – 2267 (2011).

T. I. Netzeva, M. Pavan, and A. P. Worth, QSAR Comb. Sci., 27(1), 77 – 90 (2008).

H. J. M. Verhaar, C. J. van Leeuwen, and J. L. M Hermens, Chemosphere, 25(4), 471 – 491 (1992).

C. L. Russom, S. P. Bradbury, S. J. Broderius, et al., Environ. Toxicol. Chem., 16(5), 948 – 967 (1997).

M. Nendza, A. Wenzel, Environ. Sci. Pollut. Res., 13(3), 192 – 203 (2006).

B. I. Escher, J. L. M. Hermens, Environ. Sci. Technol., 36(20), 4201 – 4217 (2002).

T. W. Schultz, M. T. D. Cronin, J. D. Walker, et al., J. Mol. Struct. (Theochem)., 622(1 – 2), 1 – 22 (2003).

A. R. Katritzky, D. B. Tatham, J. Chem. Inf. Comput. Sci., 41(5), 1162 – 1176 (2001).

H. Zhu, A. Tropsha, D. Fourches, et al., J. Chem. Inf. Model., 48(4), 766 – 784 (2008).

C. M. Ellison, M. T. D. Cronin, J. C. Madden, et al., SAR QSAR Environ. Res., 19(7 – 8), 751 – 783 (2008).

P. C. von der Ohe, R. Kuhne, R.-U. Ebert, et. al., Chem. Res. Toxicol., 18(3), 536 – 555 (2005).

О. А. Раевский, А. Н. Раздольский, В. Д. Тонкопий и др., Хим.-фарм. журн., 42(5), 49 – 55 (2008).

В. Б. Прозоровский, М. П. Прозоровская, В. М. Демченко, Фармакол. и токсикол., 41(4), 497 – 502 (1978).

О. А. Раевский, В. Ю. Григорьев, С. В. Трепалин, HYBOT. Свидетельство РОСПАТЕНТА об официальной регистрации программы для ЭВМ № 990090, (26.02.1999).

O. Raevsky, A. Sapegin, N. Zefirov, in: QSAR: Rational Approaches to the Design of Bioactive Compounds, C. Silipo and A. Vittoria, (eds.), Elsevier, Amsterdam (1991), pp. 189 – 192.

V. A. Gerasimenko, S. V. Trepalin, O. A. Raevsky, in: Molecular Modeling and Prediction of Bioactivity, K. Gundertofte and F. S. Jorgensen, (eds.), Kluwer Academic/Plenum Publishers, New York (2000), pp. 423 – 424.

I. Lessigiarska, M. T. D. Cronin, A. P. Worth, et al., SAR QSAR Environ. Res., 15(3), 169 – 190 (2004).

URL: http://software.intel.com.

URL: http://www.csie.ntu.edu.tw/~cjlin/libsvm.

URL: http://www.spss.ru.

S. Ren, Toxicol. Let., 133, 127 – 139 (2002).

S. Ren, T. W. Schultz, Toxicol. Let., 129, 151 – 160 (2002).




DOI: https://doi.org/10.30906/0023-1134-2014-48-4-21-24

Ссылки

  • На текущий момент ссылки отсутствуют.


 © Издательский дом «Фолиум», 1993–2019


Наши партнеры:

laboratorka.su          


Наши издания:
Подписаться на наши издания Вы можете через почтовые каталоги агентства «Роспечать» и Объединенный каталог «Пресса России», а также на сайтах агентств «УП Урал Пресс», «Информнаука», «Прессинформ» и «Профиздат»Адрес редакции:
Россия, Москва, Дмитровское шоссе, 157
Адрес для переписки:
Россия, 127238, Москва, а/я 42
Тел.: +7 499 258-08-28 (доб. 18)
E-mail: chem@folium.ru