Теоретическое исследование субстратной специфичности изоформ цитохрома P450

М. А. Гришина, А. А. Погребной, В. А. Потемкин, Т. Ю. Зракова

Аннотация


В рамках 3D QSAR алгоритма BiS произведено теоретическое исследование субстратной специфичности изоформ цитохрома Р450. Соединения классифицированы по характеристикам поля молекул на два вида: подвергающиеся и неподвергающиеся метаболизму на рассматриваемой изоформе. Для детального анализа реакций метаболизма проведено моделирование комплексов "субстрат - изоформа цитохрома Р450" в рамках алгоритма BiS/MC, учитывающего конформационную подвижность молекул. Выявлены количественные взаимосвязи логарифмов констант Михаэлиса соединений с характеристиками модельных комплексов. Найдены активные центры изоформ. Обнаружено, что процесс N- и O-дезалкилирования включает ориентацию N- и O-алкильных фрагментов молекул около атома кислорода, а процесс гидроксилирования/окисления - координацию окисляемых фрагментов молекул около атомов водорода модельных изоформ. Кроме того, обнаружено, что в случае изоформ 1A2, 2C19, 2E1 существенной разницы в скорости метаболизма разных конформеров субстратов не наблюдается в отличие от субстратов 3A4 и 2D6 изоформ. Найдены отличия в характере движения субстратов внутри полости изоформ.

Полный текст:

PDF


DOI: https://doi.org/10.30906/0023-1134-2005-39-10-3-7

Ссылки

  • На текущий момент ссылки отсутствуют.


© Издательский дом «Фолиум», 1993–2020


Наши партнеры:

laboratorka.su   


Наши издания:
Подписаться на наши издания Вы можете через почтовые каталоги агентства «Роспечать» и Объединенный каталог «Пресса России», а также на сайтах агентств «УП Урал Пресс», «Информнаука», «Прессинформ» и «Профиздат»Адрес редакции:
Россия, Москва, Дмитровское шоссе, 157
Адрес для переписки:
Россия, 127238, Москва, а/я 42
Тел.: +7 499 258-08-28 (доб. 18)
E-mail: chem@folium.ru