Бинарная классификация лекарственных средств центральной нервной и периферической систем

Даниил Евгеньевич Полианчик, Вениамин Юрьевич Григорьев, Герман Иванович Сандаков, Александр Валентинович Ярков, Сергей Олегович Бачурин, Олег Алексеевич Раевский

Аннотация


Построены устойчивые классификационные предсказательные модели 626 лекарственных средств центральной нервной и периферической систем на основе линейного дискриминантного анализа, логистической регрессии, методов случайного леса и опорных векторов с использованием физико-химических дескрипторов, характеризующих стерические, электростатические взаимодействия и водородную связь. Полученные модели обладают удовлетворительными статистическими характеристиками, что демонстрируется результатами внутренней кросс-валидации.

Ключевые слова


КССА; ЦНС; бинарная классификация; HYBOT

Полный текст:

PDF

Литература


Z. Rankovic, J. Med. Chem., 58(6), 2584 – 2608 (2015).

R. C. Young, R. C. Mitchell, T. H. Brown, et. al., J. Med. Chem., 31(3), 656 – 671 (1988).

H. D. van de Waterbeemd, M. Kansy, Chimia, 46, 299 – 303 (1992).

H. D. van de Waterbeemd, G. Camenisch, G. Folkers, O. A. Raevsky, Quant. Struct.-Act. Rel., 15, 480 – 490 (1996).

H. D. van de Waterbeemd, G. Camenisch, G. Folkers, et. al., J. Drug Target., 6(2), 151 – 165 (1998).

J. Kelder, P. D. J. Grootenhuis, D. M. Bayada, et. al., Pharm. Res., 16(10), 1514 – 1519 (1999).

A. K. Ghose, T. Herbertz, R. L. Hudkins, et. al., ACS Chem. Neurosci., 3(1), 50 – 68 (2012).

C. A. Lipinski, F. Lombardo, B. W. Dominy, P. J. Feeney, Adv. Drug. Del. Rev., 23(1 – 3), 3 – 26 (1997).

T. T. Wager, X. Hou, P. R. Verhoest, A. Villalobos, ACS Chem. Neurosci., 1, 435 – 439 (2010).

О. А. Раевский, С. Л. Солодова, А. А. Лагунин, В. В. Поройков, Биомед. химия, 60(2), 161 – 181 (2014).

V. A. Gerasimenko, S. V. Trepalin, O. A. Raevsky, in: Molecular Modeling and Prediction of Bioactivity, K. Gundertofte and F. S. Jorgensen (eds.), Kluwer Academic/Plenum Publishers, New York, 2000, pp. 423 – 424.

О. А. Раевский, В. Ю. Григорьев, С. В. Трепалин, «HYBOT (Hydrogen Bond Thermodynamics)», Свидетельство об официальной регистрации программы для ЭВМ № 990090 (1999), Федеральная служба по интеллектуальной собственности, Москва.

O. A. Raevsky, S. V. Trepalin, H. P. Trepalina, et. al., J. Chem. Inf. Comput. Sci., 42(3), 540 – 549 (2002).

DRAGON, version 5.5; Talete srl: Milano, Italy (2011).

http://www.stat.berkeley.edu/~breiman/RandomForests/cc_examples/prog.f.

http://www.csie.ntu.edu.tw/~cjlin/libsvm.

R. Bro, A. K. Smilde, J. Chemom., 17(1), 16 – 33 (2003).




DOI: https://doi.org/10.30906/0023-1134-2016-50-12-28-32

Ссылки

  • На текущий момент ссылки отсутствуют.


 © Издательский дом «Фолиум», 1993–2019


Наши партнеры:

laboratorka.su     


Наши издания:
Подписаться на наши издания Вы можете через каталоги «Газеты. Журналы», сайт http://press.rosp.ru/ Агентства «Роспечать», а также в киосках «Роспечать» в Брянске, Владимире, Краснодаре, Рязани и Иркутске.Адрес редакции:
Россия, Москва, Дмитровское шоссе, 157
Адрес для переписки:
Россия, 127238, Москва, а/я 42
Тел.: +7 499 258-08-28 (доб. 18)
E-mail: chem@folium.ru